URL末尾の#IDの部分は、「フラグメント識別子」と呼ばれURLの一部ではありません。
(例)http://marathon.dohow.jp/index.shtml#top における「#top」の部分
厳密に言うと、フラグメント識別子を加えたURI#fragidという形はURI参照と呼ばれます。
ブラウザがサーバーへのリクエストに使うのはURIの部分だけで、その結果得られたリソースをフラグメント識別子に対応して表示する(例えば、スクロールやハイライトするなど)はブラウザが独自に行っています。